-実験植物開発室-

下記の通り、ブラキポディウム研究に関するワークショップを開催することとなりましたので、お知らせ申し上げます。

日時　2012年11月7日(水)
場所　横浜市立大学木原生物学研究所　(横浜市戸塚区舞岡町)

プログラムなど詳細は、下記URLのホームページにございますので、ご覧ください。
http://brachy.bmep.riken.jp/wp/?page_id=91
また、参加登録はこのホームページから、10月22日(月)までにお願いいたします。

(2012/10/15)

FOXライン（イネ遺伝子強制発現系統）の提供可能なプール種子が3セットになりました。本系統についての詳細はこちらから。

(2012/10/12)

理化学研究所ゲノム科学総合研究センターとバイオリソースセンターはシロイヌナズナの転写制御因子1,069個をスポットした冊子体リソース、「RIKEN Arabidopsis cDNA Encyclopedia DNABook^TM」（シロイヌナズナ DNABook^TM ）を作成しました。このたび学術研究用途に限り試験的に配布を行うことになりましたのでお知らせ致します。ご関心のある方はplant.brc@riken.jpまでその旨お知らせください。

ご注意

1. シロイヌナズナ DNABook^TM は理研BRCが理研ゲノム科学総合研究センター（GSC）より寄託を受け保存しているシロイヌナズナ完全長cDNA（RAFL）クローンを用い、理研及び株式会社ダナフォームが保有する特許および特許出願を使用し、独立行政法人科学技術振興機構（JST）プレベンチャー事業DNAブックチームの協力の下に、理研により試作されました。このたびの配布は株式会社ダナフォームのご了解を得て学術機関を対象に試験的に行うものです。
2. 冊数に限りがありますのでなくなり次第終了とさせていただきます。
3. 提供手数料は34,650円（税込み、送料別）です。なお試験的に作成したリソースであるため研究者のご負担を軽くしていますが、購入者には簡単なアンケートへのご協力をお願い致します。
4. DNA Bookについての情報やシロイヌナズナ DNABook^TMにスポットされたクローンの情報はこちら からダウンロードできます。またシロイヌナズナの転写制御因子全体についての情報は http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ から得ることができます。
5. シロイヌナズナ DNABook^TM には１遺伝子につき2 ngのプラスミドDNAが２箇所にスポットされています。理研BRCで品質検査を行ったところ、スポットを打ち抜きdirectに反応試薬を加えてPCRを行った場合には試験したクローン全てでインサートのcDNAのバンドを確認することができました。一方プラスミドDNAをbufferまたは水で溶出しこれを用いて形質転換を行った場合には若干のクローンで形質転換コロニーが得にくい状況が認められております。また長期にわたる保存には低温・低湿の環境下が望ましいとされております。使用法の詳細につきましてはシロイヌナズナ DNABook^TMの中の記述をご参照ください。
6. シロイヌナズナ DNABook^TMに スポットされた RAFLクローンは選択的に完全長のクロ－ンを得られるよう改良された技術を用いて作られたリソースです。個別のクローンについてTAIRなどが予測している遺伝子配列と完全に一致する配列を持つことは保障致しておりませんので、予めご承知おきください。

(2012/10/05)

トランスポゾンタグラインのアノテーションをTAIR10に更新するとともに、新たに1,132系統のデータを追加しました。またホモ化した系統のみを対象とした検索が可能になりました。BRCが取得した挿入位置情報等の情報も各系統の詳細情報画面で確認できますのでご活用いただければ幸いです。

(2012/10/01)

実験植物開発室より毎月送信しておりますMAIL NEWSについて過去分も含めてホームページに掲載しました。

(2012/09/21)

日本植物学会第76回大会（9月15日～17日、兵庫県立大学）にて、シロイヌナズナ野生系統と植物培養細胞リソースを紹介します。ご質問やご意見がありましたら、ポスターセッションの時間にお立ち寄りください。（ポスター番号149, 150）

(2012/09/03)

以下の会場にて事業内容の説明を致します。会議に参加される方はぜひお立ち寄りください。

1. XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions（7月29日～8月2日、京都国際会議場）にて病虫害応答に関わるリソースを中心に紹介します。（イベントホール内、NBRP展示コーナー）
2. 第30回日本植物細胞分子生物学会大会（8月3日～5日、奈良先端大）にて植物培養細胞リソースについて紹介します。（講演番号 3Ca-10）

(2012/07/25)

7月3日より7日までViennaのHofburg宮殿にて約900名の参加者を迎えてICAR2012が開催されました。 会議ではInternational Arabidopsis Informatics Consortium (IAIC)の活動や1,001 Genomes Projectの現状も紹介されました。 前者に関しては、来年8月に活動を終了するTAIRのデータベースを当面iPlant Collaborativeのサイトに移し、その後予算を獲得してArabidopsis Information Portal (AIP)が引き継ぐ構想が紹介されました。 TAIRの移管を含めたIAICのレポートは、Plant CellのOnline Ahead of Printにも6月29日付けで掲載されています。
本会議の要旨集PDFは会議ホームページよりダウンロードできます。またICAR2013はSydneyで2013年6月24-28日に開催予定です。

 

(2012/07/19)